Im Studium wird die Historische Musikwissenschaft an der Hochschule für Musik und Tanz Köln im Bachelor-, Master- und Promotionsstudium unterrichtet. Während sie im Bachelor als Grundlagenfach für alle musikalisch-künstlerischen und musikpädagogischen Studiengänge an allen drei Standorten (Köln, Wuppertal, Aachen) dient, bieten der Master Musikwissenschaft und die Promotion Musikwissenschaft die Möglichkeit zur Professionalisierung und Forschung am Standort Köln. Es gehört zum Selbstverständnis des Institutes, Studierende aller Ausbildungsstufen an den Forschungsaktivitäten zu beteiligen.
Der zweijährige Studiengang Master of Arts Musikwissenschaft bietet einen Einstieg in die Forschung und die Vorbereitung zum Promotionsstudium.
Das IHM ist mit mehr als zwanzig Promovierenden ein internationales Forum für den musikwissenschaftlichen Nachwuchs.